Torpedy wykorzystywane w grze Silent Hunter 3 można podzielić na 4 grupy: z napędem parogazowym, z napędem elektrycznym, z programatorem oraz samonaprowadzane akustycznie. Na początku wojny mamy do dyspozycji tylko dwa rodzaje torped T1 i T2. Z biegiem czasu dochodzą unowocześnione T3 (1941 r.) oraz torpedy z programatorami FaT (1941-42) i LuT (1943-44) oraz torpedy z zapalnikami akustycznymi: Falke (1942) , Zaunkönig I (1943) oraz Zaunkönig II (1944) .
T1 - torpeda wynaleziona przed wojną. Powszechnie stosowana na początku wojny. Największą wadą tej torpedy jest jej napęd. Torpeda tego typu zostawia za sobą widoczny z daleka ślad (tzw. kilwater) utworzony z pęcherzyków powietrza. Zdradzała przez to pozycję okrętu wystrzeliwującego torpedę oraz dawała szansę załodze statku na zrobienie uniku. Stosowana głównie w nocy więc i my radzimy ją używać w nocy. Do zalet torpedy należy jej szybkość (44 węzły) oraz zasięg (ok. 14 km).
T2, T3 - ten typ torpedy był najczęściej stosowany mimo początkowych problemów (rozwiązanych po Kampanii Norweskiej) z jej zapalnikami oraz urządzeniami odpowiedzialnymi za utrzymywanie odpowiedniej głębokości. Napędzana była silnikiem elektrycznym przez co nie pozostawiała żadnego widocznego. Torpeda T3 miała powiększoną pojemność baterii w stosunku do T2 i co za tym idzie większy zasięg (7,5 km). T2 i T3 rozwijały ok. 30 węzłów.
FaT I, FaT II - były to zmodyfikowane torpedy typu T1 i T2. Dodano do nich programator Federapparat Torpedo. Torpeda została zaprojektowana do zwalczania konwojów. Na zaprogramowanym odcinku poruszała się po linii prostej, a następnie zaczynała zygzakować w również zaprogramowanym kierunku. Zmiany kursu można było ustawić co około 800 lub 1500 metrów.
LuT I, LuT II - były to torpedy o dużym zasięgu z programatorem pozwalającym ustawić kurs torpedy tak, aby po przebyciu danego odcinka zaczęła zygzakować lub krążyć. Torpedy LuT były przystosowane do wystrzeliwania z dużych głębokości (do 50 m).
Falke, Zaunkönig I, Zaunkönig II - prace nad tą bronią zaczęły się już w roku 1936. Pierwsze użycie bojowe nastąpiło w 1943 r. Były to torpedy samonaprowadzane akustycznie (na odgłos śruby okrętów).Należąlo je wystrzelić mniej więcej w kierunku celu resztę robiła sama torpeda. Falke ze względu na swoją małą prędkość była głównie stosowana przeciwko statkom handlowym. Niszczyciele mogły ją wymanewrować. Zaunkönig I miały być cudowną bronią przeciwko eskortowcom. Posiadały już zapalnik magnetyczny oraz rozwijały większą prędkość. Niemieccy konstruktorzy w odpowiedzi na foxera (urządzenie imitujące odgłos śruby okrętowej ciągnięte za statkiem) wprowadzili Zaunkönig II, które miały być mało wrażliwe na urządzenia zakłócające. W rzeczywistości torpedy tego typu nie zostały użyte w operacjach bojowych, jednak w grze możemy się w nie zaopatrzyć.